Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFAP3Q92845 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms