Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX1Q92499 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX1Q92499 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms