Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CSRNP3Q8WYN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CSRNP3Q8WYN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms