Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNKSR2Q8WXI2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNKSR2Q8WXI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms