Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms