Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12Q8WVT3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12Q8WVT3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms