Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GIPC3Q8TF64 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms