Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAF3IP1Q8TDR0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms