Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPPL3Q8TCT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms