Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD1Q8NHV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms