Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms