Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG48

LINS1, Protein Lines homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1Q8NG48 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINS1Q8NG48 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINS1Q8NG48 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms