Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU7

TET1, Methylcytosine dioxygenase TET1, humanhuman

Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET1Q8NFU7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TET1Q8NFU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms