Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC9Q8NEP7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC9Q8NEP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms