Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK4Q8NE63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK4Q8NE63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms