Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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