Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms