Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LINC00116Q8NCU8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00116Q8NCU8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00116Q8NCU8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms