Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD1Q8NBU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD1Q8NBU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD1Q8NBU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD1Q8NBU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms