Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL23Q8NBE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms