Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms