Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP38Q8NB14 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP38Q8NB14 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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