Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR7Q8N806 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms