Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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