Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL2Q8N4E4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCL2Q8N4E4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms