Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LGI3Q8N145 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGI3Q8N145 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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