Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4X1Q8N118 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4X1Q8N118 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms