Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
P3H3Q8IVL6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
P3H3Q8IVL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
P3H3Q8IVL6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms