Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC25Q86WR0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms