Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms