Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
STRCQ7RTU9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRCQ7RTU9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms