Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTF1AQ7RTS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms