Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NLRC3Q7RTR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms