Protein–RNA interactions for Protein: Q7L014

DDX46, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX46Q7L014 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX46Q7L014 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX46Q7L014 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX46Q7L014 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX46Q7L014 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX46Q7L014 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms