Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFLNAQ6ZTI6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms