Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A48Q6ZT89 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A48Q6ZT89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms