Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBR3Q6ZT12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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