Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC129Q6ZRS4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC129Q6ZRS4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms