Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRP0

PRR23C, Proline-rich protein 23C, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23CQ6ZRP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23CQ6ZRP0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23CQ6ZRP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms