Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIAT1Q6ZQX7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIAT1Q6ZQX7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms