Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms