Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
H3F3CQ6NXT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms