Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms