Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM68Q6AZZ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM68Q6AZZ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms