Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND4CQ5VZ89 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms