Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00242Q5T6M2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms