Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC3LQ5T215 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3LQ5T215 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms