Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms