Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSL3PQ5NE16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSL3PQ5NE16 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSL3PQ5NE16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSL3PQ5NE16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSL3PQ5NE16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSL3PQ5NE16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms