Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP78Q5JTW2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP78Q5JTW2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms